Провел анализ ошибки.
Питерский разработчик ГК Омега по непонятным причинам встроил в конфигурацию закрытый от просмотра и редактирования модуль, который, помимо поиска дублей библиографических записей при их создании и редактировании, проверяет количество экземпляров в фонде, и когда оно превышает 1 000 000 - выдает ошибку "Объем фонда превысил 1 000 000 экземпляров. Дальнейшее пополнение электронного каталога невозможно!" Из-за этого же возникала ошибка и при создании номеров журналов.
Из каких соображений это сделано - можно только догадываться.
На данный момент я реализовал обход данной ошибки, но необходимо дождаться поставки (сегодня вечером).